藥物化學部分按治療作用分類闡述藥物的類型、名稱、化學結構、理化性質、體內代謝及構效關系等方面內容，是執業藥師必備的藥學專業知識的重要組成部分。
　　本部分所要求的藥物品種的選擇依據是2000版《中華人民共和國藥典》（二部)、2000年頒布的《國家基本藥物目錄》(分別用"典"和"基"表示）及目前常用的新藥。
　　根據執業藥師的職責與執業活動的需要，藥物化學知識考試內容的總體要求分為掌握、熟悉和了解三個層次：
　　掌握：常用藥物的名稱、化學名、化學結構、理化性質和用途；化學結構和穩定性之間的關系；一些重要藥物在體內外相互作用的化學變化，體內發生的與代謝有關的化學變化和對生物活性的影響。
　　熟悉：手性藥物的立體化學結構、構型和生物活性特點；藥物在生產和貯存過程中可能產生的雜質及其原因；特殊管理藥品的結構特點和臨床用途。重要藥物類型及其構效關系。藥物理化性質和藥效的關系；藥物的代謝化學。
　　了解：各類藥物的發展過程和現狀；近年來上市的新藥；藥物結構修飾的作用和方法；新藥的研究與開發。
【考試內容】
1.藥物的化學結構與藥效的關系
熟悉藥物的溶解度、分配系數、解離度、電子密度、取代基和立體因素對藥效的影響。
2.藥物代謝
熟悉藥物在體內代謝的化學變化類型。
3.麻醉藥
掌握麻醉藥的分類。
掌握代表藥物思氟烷（基）、鹽酸氯胺酮（典、基）、依托咪酯（典、基）、鹽酸普魯卡因（典、基）、鹽酸利多卡因（典、基）的化學名、結構、理化性質及用途。
熟悉氟烷（典）、丙泊酚（基）、鹽酸丁卡因（典、基）、鹽酸布比卡因（典、基）的結構、作用特點及用途。
熟悉局麻藥的構效關系。
了解麻醉藥的發展和現狀。
4.鎮靜催眠藥、抗癲病藥和抗精神失常藥
掌握鎮靜催眠藥、抗癲癇藥和抗精神失常藥的類型。
掌握代表藥物苯巴比妥（典、基）、地西伴（典、基）、苯妥英鈉（典、基）、卡馬西平（典、基）、奮乃靜（典、基）的化學名、結構、理化性質及用途。
掌握奧沙西伴（典）、艾司唑侖（典、基）、阿普唑侖（典、基）的結構、理化性質及用途。熟悉異戊巴比妥（典、基）、硫噴妥鈉（典、基）、唑毗坦（基）、丙戊酸鈉（典、基）、鹽酸氯丙嗪（典、基）、硝西伴（典、基）、氟西汀（基）、舒必利（典、基）的結構、作用特點及用途。
了解氟氟哌啶醇(典、基）、鹽酸阿米替林（典、基）的結構和臨床應用。
熟悉巴比妥類藥物和苯并氮卓類藥物的構效關系和體內代謝。
了解吩吩噻類藥物的構效關系及抗精神病藥的發展和現狀。
5.非甾抗炎藥
掌握解熱鎮痛藥、非甾抗炎藥的結構類型。
掌握代表藥物阿司匹林（典、基)、對乙酰氨基酚（典、基)、吲哚美辛（典、基）、雙氯芬酸鈉（典、基）、布洛芬（典、基）的化學名、結構、理化性質和用途。
掌握貝諾酯（典）、安乃近（典）。萘普生（典、基）的結構、理化性質及用途。
熟悉萘丁美酮（基)、芬布芬（典)、舒林酸（典、基)、酮洛芬（典)、毗羅昔康（典）、美洛昔康（基）、別瞟醇（典、基）、丙磺舒（典、基）和秋水仙堿（典、基）的結構、作用特點和用途。
了解解熱鎮痛藥、非甾抗炎藥和抗痛風藥的發展和現狀。
6.鎮痛藥和鎮咳祛痰藥
掌握鎮痛藥的結構類型。
掌握代表藥物鹽酸哌替啶（典、基)、鹽酸溴己新（典、基）的化學名、結構、理化性質及用途。
掌握代表藥物鹽酸嗎啡（典、基)、拘櫞酸芬太尼（典、基)、鹽酸美沙酮（典）的結構、理化性質及用途。
熟悉鹽酸納絡酮（典、基）、右丙氧芬、鹽酸曲馬多（典、基）、酒石酸布托啡諾、鹽酸布桂嗪（典、基）。苯噻啶（典、基）、磷酸可待因（典、基）的結構、作用特點和用途。
熟悉鎮痛藥的構效關系及屬特殊管理的藥品的結構特征。
了解鎮痛藥和鎮咳祛痰藥的發展和現狀。